Genômica comparativa e evolutiva de Leptospira

Auteurs

  • Natalia Rego Institut Pasteur de Montevidéo, Unidad de Bioinformática, Montevidéo, Uruguai
  • Hugo Naya Institut Pasteur de Montevidéo, Unidad de Bioinformática, Montevidéo, Uruguai
  • Guillermo Lamolle Universidad de la República, Sección Biomatemática, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay
  • Fernando Álvarez-Valin Universidad de la República, Sección Biomatemática, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay

DOI :

https://doi.org/10.3395/reciis.v1i2.928

Mots-clés :

Leptospira, redução de genoma, conteúdo GC, taxas de substituição, gama de hospedeiros

Résumé

A disponibilidade de seqüências genômicas completas tem possibilitado o estudo de mudanças no conteúdo gênico e nucleotídico durante a evolução de linhagens de bactérias patogênicas e simbióticas. Aqui nós apresentamos resultados de genômica comparativa entre quatro cepas pertencentes a duas espécies, Leptospira interrogans (L. interrogans Lai str. 56601 e L. interrogans Copenhageni str. Fiocruz L1-130) e L. borgpetersenii (L. borgpetersenii sorovar Hardjo-bovis str. JB197 e L. borgpetersenii sorovar Hardjo-bovis str. L550). As duas cepas da última espécie reduziram sua gama de hospedeiros estando restritas a um ciclo de transmissão hospedeiro-a-hospedeiro enquanto o anterior pode sobreviver por longos períodos em água doce. Uma análise composicional e substitucional detalhada em 2416 quartetos de ortólogos indica que esta mudança nas condições do ambiente está acompanhada de mudanças no conteúdo GC genômico afetando todo o genoma. Além disso, esta análise revela que a divergência entre espécies é surpreendentemente vasta, com uma razão de distâncias sinônimos / aminoácidos igual a 7.17, uma proporção muito maior do que em outros grupos. Nós mostramos que esta razão elevada é uma indicação de aceleração nas taxas de substituição que afetaram especialmente as posições sinônimas estando conectada à mudança na composição de bases já descrita. Nós postulamos que este processo ocorreu especificamente no ramo que leva a L. borgpetersenii.

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Publiée

2007-12-31

Comment citer

Rego, N., Naya, H., Lamolle, G., & Álvarez-Valin, F. (2007). Genômica comparativa e evolutiva de Leptospira. Revue De La Communication, De l’Information Et De l’Innovation En Santé, 1(2). https://doi.org/10.3395/reciis.v1i2.928

Numéro

Vol. 1 No 2 (2007): Suplemento - Bioinformática e Saúde

Rubrique

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